Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms