Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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ITGA9Q13797 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGA9Q13797 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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