Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
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