Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms