Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms