Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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FOXF1Q12946 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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FOXF1Q12946 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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FOXF1Q12946 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF1Q12946 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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