Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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HOXD13P35453 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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HOXD13P35453 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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HOXD13P35453 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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HOXD13P35453 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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