Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PTPRGP23470 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
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