Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRFP10586 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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