Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDGFDQ9GZP0 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms