Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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