Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms