Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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RASGEF1AQ8N9B8 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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RASGEF1AQ8N9B8 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RASGEF1AQ8N9B8 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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