Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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CCDC93Q567U6 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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CCDC93Q567U6 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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CCDC93Q567U6 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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CCDC93Q567U6 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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CCDC93Q567U6 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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CCDC93Q567U6 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC93Q567U6 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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