Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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SYCP1Q15431 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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