Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RUNX3Q13761 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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