Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms