Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC090692.1-201ENST00000531569 541 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC138207.6-201ENST00000579164 1967 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MEIS1-216ENST00000560281 2773 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 GSTA10P-201ENST00000412182 576 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC112219.1-201ENST00000491567 947 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC135388.1-201ENST00000536512 353 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC092142.1-202ENST00000567021 829 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms