Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms