Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms