Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDGFDQ9GZP0 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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