Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms