Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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C9orf40Q8IXQ3 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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C9orf40Q8IXQ3 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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C9orf40Q8IXQ3 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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C9orf40Q8IXQ3 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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C9orf40Q8IXQ3 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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C9orf40Q8IXQ3 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf40Q8IXQ3 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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