Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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