Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.9 ms