Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC96Q2M329 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms