Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms