Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.3 ms