Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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TRAF1Q13077 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TRAF1Q13077 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TRAF1Q13077 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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