Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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