Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms