Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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