Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
POLKQ9UBT6 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms