Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms