Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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ZNF548Q8NEK5 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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