Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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LTBP4Q8N2S1 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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LTBP4Q8N2S1 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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LTBP4Q8N2S1 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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LTBP4Q8N2S1 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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LTBP4Q8N2S1 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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LTBP4Q8N2S1 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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LTBP4Q8N2S1 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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LTBP4Q8N2S1 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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LTBP4Q8N2S1 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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