Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SOX4Q06945 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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SOX4Q06945 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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SOX4Q06945 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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