Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms