Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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