Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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