Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC015674.1-201ENST00000578482 267 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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