Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
USP41Q3LFD5 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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