Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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SIX1Q15475 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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SIX1Q15475 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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SIX1Q15475 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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SIX1Q15475 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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