Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHD4Q14839 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms