Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2BQ00403 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms