Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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