Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms