Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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