Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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VPS72Q15906 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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VPS72Q15906 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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VPS72Q15906 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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