Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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SP140Q13342 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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SP140Q13342 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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SP140Q13342 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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SP140Q13342 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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SP140Q13342 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SP140Q13342 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SP140Q13342 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SP140Q13342 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
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